Wann FPGA-Code neu kompilieren?

Hallo,

das würde ich persönlich nicht machen. Die Scan-Engine soll dir Arbeit abnehmen, wenn du von FPGA keine Ahnung hast oder wenn du ohne FPGA-Toolkit auskommen möchtest. Einen anderen Vorteil sehe ich ihn ihr nicht.
Nutze lieber ausschließlich das FPGA. Die Karten sind schnell konfiguriert und über DMA-FIFOs z.B. bekommst du die Messwerte auch problemlos in deine RT-Anwendung.
Die Performance steigt, die Kompilierzeit sinkt.

Dass dies deine Frage nicht beantwortet, ist mir klar.
Aber mal die Gegenfrage: Wozu möchtest du den sog. Hybrid-Modus nutzen?