Synchronisation (Triggern) von Countern und AI/O bzw. DI/O

Habe jetzt nicht Zeit ausführlich zu antworten, hier nur ein Hinweis:
Zum Thema Synchronisation von DAQ-Tasks gibt es ca 20 Beispiele in:
--> Signalerfassung und -ausgabe mittels Hardware
--> DAQmx --> Synchronisation
Es ist anzunehmen, daß Dein Problem in einem Beispiel (oder einem ähnlichen) behandelt ist.
Ich selbst habe mehrere Tage diese Beispiele variiert und damit experimentiert, bis ich das Thema einigermaßen beherrschte. Auf jeden Fall würde ich raten, nicht ganz von vorn auf eigenes Risiko zu beginnen, sondern ein ähnliches Beispiele aus der Sammlung zu nehmen und das für den eigenen Zeck zu modifizieren.
Also: Suche mal und experimentiere, und wenn Du Fragen hast, melde Dich wieder.