Welche Art von Protokollierung?

Ich denke hier macht es Sinn erstmal die Grundbedingungen zu benennen:

• Die Zeitabstände der Daten sind äquidistant
• Jeder Zyklus soll separat abgelegt werden
  

Ich würde die Messdaten folgendermaßen strukturieren:
|-Zyklus 1
|- Kanal 1
|- Kanal 2
|-...
|- Kanal n
|-Zyklus 2
|- Kanal 1
|- Kanal 2
|-...
|- Kanal n

Zyklus M ist entsprechend der Gruppenname und Kanal N der Kanalname im TDMS Schreiben bzw. Lesen. Bei äquidistanten Messdaten kannst du dann die Übergabe direkt über eine Waveform realiseren mit Angabe von t0 (Startzeit) und dt (Zeitabstand). Sollte dies nicht funktionieren ist ein typischer Ansatz die Verwendung eines separaten Zeitkanals mit direkter Zuordnung zu allen Kanälen der Gruppe.