Phasenverschiebung: zwei Eingangssignale

' schrieb:Was heisst denn "richtige Konfiguration"? Ich habe den virtuellen Kanal eingestellt, der gemessen werden soll und Typ der Messung (also Abtastung eines analogen Kanals mit mehreren Abtastwerten).

"Richtige Konfiguration" heißt, dass du alle zu messenden Kanäle zu EINEM Task vereinst. Also "Create Task", dann "Create Channel" so oft, wie du das brauchst (in deinem Fall wohl 2x hintereinander). Und danach erst die Messungen starten.
Dann ist die Zeitdifferenz zwischen den Messungen beider Kanäle nur durch deinen MUX begrenzt und sollte im ns-Bereich liegen.