Messwerte speichern -> X Achse soll die Systemzeit sein

Dein Problem scheint folgendes zu sein: Die große While-Schleife außen läuft nicht ständig durch, weil du in den kleineren Schleifen zur Motorstäuerung hängen bleibst. Damit wird die Bedingung für den unteren Case (und dieser selber auch) nur genau 1x ausgeführt. Abhilfe schaffen statt einer großen While-Schleife zwei kleinere parallele - eine um die Motorsteuerung, eine um die Datenerfassung.

Übrigens scheinst du den Hinweis noch nicht zu kennen, dass man einen Rechtsklick auf Eingänge von VIs machen kann und dann Create -> Constant. Damit hat man immer den richtigen Datentyp für Konstanten, Controls und Indicators. Bei dir wird fast überall erst eine Datentyp-Konvertierung durchgeführt. Du nimmst sicherlich die Standard-Konstante aus der Funktions-Palette...