Komisch: Du "weißt", dass Du die Einstellung "shift=true" verwenden musst, bei der es in der Darstellung keine negativen Frequenzen gibt, wunderst Dich aber dann darüber, daß genau das der Fall ist.
Ich kann Dir hier nur diesen Rat geben: Vergiss die Funktion FFT, und nimm die unendlich komfortableren Funktionen in Signalverlauuf/Messuungen, also z.B. die beiden Funktionen "FFT-Spektrum Betrag/Phase" oder "...Real/Imaginär". Ich würde sogar sagen, dass es bei deiner Aufgabenstellung auf das Leistungsspektrum ankommt. Dafür gibt es auch ein VI.
Korrektur (Falsches jetzt Schrägschrift!)
Bei "Shift=true" hat man negative und positive Frequenzen (Mathematisch gesehen, physikalisch gibt es das nicht), da hattest Du recht. Dass das im Graph nicht so dargestellt wird, liegt einfach daran, dass die Ausgabe als Array erfolgt und im Graphen auf der X-Achse nicht die Frequenzen, sondern nur die Indizees des Arrays dargestelltwerden, die niemals negativ sind. Man muß also die X-Achse, damit Frequenzen daraus werden, noch verschieben. z.B. so: