Hallo,
lade mal Dein VI hoch. Ich kann mir nämlich beim besten Willen nicht vorstellen, wieso Deine Whileschleife mit einem "Control" am "Stop" nicht anhalten soll, außer Du hast evtl. ein SubVI, das noch nicht fertig abgearbeitet ist?
Oder hast Du eine Zeitverzögerung in der Whileschleife vergessen und Deine CPU läuft jetzt am Limit? Wenn Du keine Zeitverzögerung in Deiner Whileschleife hast, dann pack mal eine rein, mit z.B. 10 ms.... Das reicht schon.
Am besten einfach mal das VI hochladen, dann schau' mer mal.
Gruß Markus