serielle Schnittstelle freigeben nach "Ausführung abbrechen"?

Ja, warum beendest Du das Programm auch nicht normal? Dies Art des Abbruch entspäche dem Beenden einer Autofahrt durch Fahren gegen einen Baum - las ich gerade gestern hier im Forum.
Aber in Deinem Fall solltest Du wenigsten beim Start des Programm die VISA-Schnittelle zuerst schließen, bevor Du neu konfigurierst.

Edit: Andere waren schneller. Aber zu Deine Frage:

Zitat:Es scheint mir trotzdem nicht plausibel warum das VI nicht erkennen kann das es selbst den Port blockiert.

Das habe ich mich auch lange Zeit gefragt, bis mir ein plausible Antwort einfiel:
Labview kann eben nur erkennne, daß der Port blockiert ist, aber nicht wer es ist. Es könnnte also auch ein ganz anderes parallel laufendes Windows-Programm sein. Es wäre ein Leichtes, bei der Konfiguration den Port erst mal zurückzusetzen. Aber damit würde man möglicherweise in ein anderes Windows-Progrogramm eingreifen, und das darf natürlich nicht sein.
Die Antwort von Tschac gefällt mir übrigens am besten, werde das bei mir so einstellen.