Kommunikation zw. Haupt- und Sub-VI

Schau dir mal die beiden VIs an. Das Datenverbraucher-Vi ist das Hauptprogramm, das Datenerzeuger-VI entspricht Deinem DAQmx-VI. Die erzeugten Daten werden über einen Melder (oder besser Queue) an das Hauptprogramm gegeben. Das Sub-Vi synchronisiert das Haupt-VI, da der Melde-Empfänger immer werten muß, bis neue Daten anliegen.
Wenn das Hauptrogramm gestoppt wird. wird der Melder "zerstörend" freigegeben. Das erzeugt natürlich im Melde-Sender im Sub-Vi eine Fehlermeldung. Diese beendet das Sub-VI.
Man kann es natürlich auch anders machen, aber Du wirst sowieso nicht umhin können, ein Queue zur Datenübertragung zum Hauptprogramm zu verwenden. Dann ist es so das Einfachste.
(Beim Datentransport über eine globale Variable hättest Du, abgesehen davon das es langsamer ist, das Problem der Synchronisation)