Butterworth Filter

Ich muss dich leider enttäuschen: es kommt genau an, was ankommen sollte.

Sagt dir Einschwingen, Grenzfrequenz, Samplingdauer etwas?
Wenn ja, hätte es dir selbst auffallen können, wenn nicht -> lies dich in das Thema mal ein!

Jetzt zu deinem Problem:
Dein Signal hat eine Samplerate von 1kHz und zeigt 1000samples an und wenn du dann ein Tiefpass mit einer Grenzfrequenz von 1kHz machst, kann ja nichts rauskommen.
Aendere mal die Samples auf 10000 und reduziere die Grenzfrequenz auf 200, dann kommt raus, was du erwartest! Das Einschwingverhalten am Anfang ist normal!

Noch ein kleiner Tip am Rande: Finger weg von den Express-VIs, oder besser gesagt, wenn du sie schon verwendest, dann schau dir die Konfiguration genaustens an, sonst kann dir was entgehen und du suchst eweig nach dem Fehler!

Gruss,
Christian