Timing Problem für Counter

Hallo,

ich Arbeite zur Zeit an einem einfachen Zähler.
Das Messinstrument gibt TTL Signale an die NI PCI-6035E Karte gesendet.
Die Signale Zähle ich über den Internen Counter aus.
Ziel ist es am Ende Zeitaufgelöst die Ereignisse darzustellen.

Ich habe ein Screenshot des Programms einmal angehängt.

Zur Zeit gebe ich mit einem Freuqenzgenerator TTL Signale auf die Messkarte ab einer Freuqeunz von etwa 1kHz fällt auf, dass das zweite Auszählen scheinbar zu einem Willkürlichen Zeitpunkt erfolgt obwohl es erst nach der vorgegeben Messzeit erfolgen soll. Das interesante ist, es liegen immer zuwenig Messwerte vor.

Hier noch einmal der Ablauf Grob:
Programm Startet -> Der Counter wird Gestartet -> Die Schleife wird betreten -> Der Erste Wert wird ausgelesen (Und zwar die Korekkten 0 Counts) -> Die Schleife wartet die Messzeit (soll es zumindestens) bis zur nächsten Ausführung-> der counter wird ausgelesen und die Zahl wird gespeichert *-> Scheleife wartet wieder -> usw

* An der Stelle hier scheint ein Fehler zu sein da nicht die Korrekte Anzahl ausgelesen wird bzw in dem Schritt davor weil nicht die richtige Zeit gewartet wird.

Wo könnte der Fehler liegen oder was könnte das Problem verursachen ?
Schon einmal Danke im Voraus

Gruß

Alex