Amplitude und Phase eines gemessenen Sinussignals ermitteln

Micheal hat Recht, um Fourieranalyse kommst Du nicht herum - alledings wird das durch fertig bereitgestellte Funktionen sehr erleichtert.

Die Größte Schwierigkeit ist aber erst mal, bei der Datenerfassung Ausgang und Eingang miteinander zu synchronisieren. D.h. wenn Du statt des Gerätes Ausgangs- und Eingangs-Pin direkt verbindest, muß ein Linearer Frequenzgang mit Null Phasendrehung heruskommen (Input = Output). Aber gottseidank war das nicht Deine Frage

Wenn Du das geschafft hast, einfach die Funktion "Frequency Response Function" verwenden.
Zum Fenstern: Nicht fenstern (Fenster = "rechteck"), besser die Erfassung so einrichten, daß genau eine Periode oder ein ganzzahliges Vielfaches des anregenden Sinus erfasst wird.
Das VI hat Mittelwertbildung eingebaut. Ich würde nur eine Periode erfassen, und die Messung x-mal wiederholen. Das VI mittelt das dann.