Buffer läuft während des speicherns über

Hallo,
Ich verwende ein C-rio 9072 und erfasse mit meinem Programm Messwerte mit 10kHz. Die Werte übertrage ich von dem FPGA per DMA (schreibe sie in ein FIFO) und lese sie dann wieder aus und verarbeite sie weiter. Das ganze funktioniert auch ganz gut. In bestimmten Abständen will ich die verarbeiteten Werte abspeichern , dazu habe ich mir ein Subvi geschrieben welches in meinem Fall die Werte auf einer SD-Card (Modul 9802) speichert. Leider läuft während des Speichervorgangs mein Buffer über. Ich will aber das ich während des Speichervorgangs weiter abtaste. Gibt es da irgendwelche Tricks, dass man speichern und abtasten parallel ausführen kann. Ich habe schon die größe des FIFOs erhöht doch leider hat es nichts bewirkt.
Vielen Dank
Gruß Benjamin